Un modelo semicuantitativo de funcionamiento hidrogeológico de las albuferas de Adra (Honda y Nueva) se ha establecido a partir de controles periódicos de diferentes variables durante 1999 y 2000 y se ha comprobado con un balance hídrico mensual. El acuífero deltáico en que se sitúan las lagunas muestra variaciones piezométricas en los últimos 25 años inducidas por modificaciones en la recarga (regulación del río Adra en 1982). En el periodo estudiado la albufera Honda está alimentada sobre todo por aguas procedentes de canales de riego y de ramblas. Su carácter predominante respecto al acuífero es influente, especialmente en periodos de aportaciones importantes. Una fracción mayoritaria de su descarga subterránea alimenta la albufera Nueva, desde la cual, en ciertos periodos, se produce descarga subterránea hacia el mar. Presenta, pues, flujo subterráneo entrante y saliente. Esta laguna, de carácter global efluente, también recibe en la actualidad aportaciones de canales de riego.