Las funciones de los Organismos de cuenca, también denominados Confederaciones Hidrográficas, están reguladas en el artículo 25 del Real Decreto 927/1988, que aprueba el Reglamento de la Administración Pública del Agua y de la Planificación Hidrológica.
Estas funciones son las siguientes: La elaboración del plan hidrológico de cuenca, así como su seguimiento y revisión. La administración y control del dominio público hidráulico. La administración y control de los aprovechamientos de interés general o que afecten a más de una Comunidad Autónoma. El proyecto, la construcción y explotación de las obras realizadas con cargo a los fondos propios del Organismo, y las que les sean encomendadas por el Estado. Las que se deriven de los convenios con Comunidades Autónomas, Corporaciones Locales y otras Entidades públicas o privadas, o de los suscritos con los particulares.
A través del web además de la descripción, marco legal, plan hidrológico e infraestructuras de la cuenca se ofrece información hidrológica (SAIH) y medioambiental (Red ICA y SAICA).

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