Las variaciones asociadas a cambios en el nivel y el estado del canal en el río Magdalena en Colombia (América del Sur) con frecuencia afectan a las posibilidades de navegación para los barcos y transbordadores, que causan los altos costos para sus usuarios. Por esta razón, este trabajo presenta un modelo bio-inspirados para apoyar la toma de decisiones relativas a la navegación mediante un enfoque neuro-fuzzy desarrollado en trabajos anteriores con una nueva aplicación. Teniendo en cuenta los niveles medios diarios del río registrado por las estaciones de limnigraphical del Instituto Colombiano de Hidrología, Meteorología y Estudios Ambientales (IDEAM), durante el período entre 1998 y 2003 para el Puerto Salgar, Puerto Berrío, El Banco y Calamar lugares, era posible diseñar y establecer un modelo hidrológico neuro-fuzzy para predecir con gran precisión el nivel de agua en el río para la ruta de la navegación, permitiendo que la decisión adecuada de decisiones para los operadores del río Magdalena a pre-determinar el peso de embarque para cualquier barco o ferry en su ruta. El modelo desarrollado mostraron un mejor rendimiento para la predicción de los modelos previamente establecidos determinista para esta aplicación específica.